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生科院鄭珩/勞興珍團(tuán)隊(duì)在生命科學(xué)學(xué)科頂尖期刊《Nucleic Acids Research》上發(fā)表促進(jìn)抗菌肽臨床轉(zhuǎn)化的DRAMP數(shù)據(jù)庫(kù)的最新研究成果

 近日,生命科學(xué)學(xué)科頂尖期刊Nucleic Acids ResearchIF=16.6)在線發(fā)表了我校生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院鄭珩課題組的最新研究成果:DRAMP 4.0: an open-access data repository dedicated to the clinical translation of antimicrobial peptides。我校碩士研究生馬天玥為論文第一作者,鄭珩副教授及勞興珍副教授為本文的共同通訊作者,中國(guó)藥科大學(xué)為本文的唯一通訊單位。

細(xì)菌耐藥性是當(dāng)前全球公共衛(wèi)生領(lǐng)域面臨的重要問(wèn)題之一。抗菌肽具有廣譜抗菌活性,作用機(jī)制獨(dú)特,較難誘導(dǎo)耐藥,在耐藥細(xì)菌感染臨床上具有重要應(yīng)用前景,但受限于穩(wěn)定性、溶血性以及細(xì)胞毒性等性質(zhì),目前進(jìn)入臨床研究的抗菌肽仍較少。DRAMP(Data repository of antimicrobial peptides, http://dramp.cpu-bioinfor.org/)第4版更新側(cè)重于抗菌肽的臨床轉(zhuǎn)化,首次添加了抗菌肽血清/蛋白酶半衰期穩(wěn)定性數(shù)據(jù),并補(bǔ)充了大量實(shí)驗(yàn)測(cè)定的抗菌肽溶血/細(xì)胞毒性數(shù)據(jù)。除此以外,本次更新新增了8000多條抗菌肽條目,包括來(lái)自中文文獻(xiàn)的抗菌肽信息。這些信息和數(shù)據(jù)可以免費(fèi)從數(shù)據(jù)庫(kù)的download界面下載,可用于促進(jìn)人工智能輔助的抗菌藥物設(shè)計(jì)。

該工作受到863項(xiàng)目、重大新藥專項(xiàng)、國(guó)家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目和江蘇高校優(yōu)勢(shì)學(xué)科建設(shè)工程項(xiàng)目等資助。我校徐寒梅教授對(duì)本數(shù)據(jù)庫(kù)的立項(xiàng)和建設(shè)給予了重大支持和幫助,碩士研究生孫健、范琳琳、康馨月和施國(guó)邦等參與前三版數(shù)據(jù)庫(kù)的建設(shè)和更新工作。

文章鏈接:https://doi.org/10.1093/nar/gkae1046

(供稿單位:生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,撰寫(xiě)人:姚嘉儀,審稿人:劉帆)





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